Nous nous proposons de comparer deux capacités dans $\mathbb C^n$ définies par les orbites périodiques de systèmes hamiltoniens. La première est la capacité de Floer-Hofer, issue de l'homologie symplectique ; la seconde est la capacité de Viterbo basée sur des fonctions génératrices. Nous montrons que la capacité intérieure de Floer-Hofer n'est pas plus grande que celle de Viterbo et qu'elles coïncident sur les ouverts dont le bord est une variété de contact restreinte. Nous montrons enfin que la capacité de Viterbo d'une sous-variété lagrangienne compacte n'est jamais nulle.